MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS4

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016840	T	6	6	231	236	0 %	100 %	0 %	0 %	378976147
2	NC_016840	ATAGC	2	10	237	246	40 %	20 %	20 %	20 %	378976147
3	NC_016840	TCG	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976147
4	NC_016840	T	7	7	330	336	0 %	100 %	0 %	0 %	378976147
5	NC_016840	TTCG	2	8	365	372	0 %	50 %	25 %	25 %	378976147
6	NC_016840	T	7	7	394	400	0 %	100 %	0 %	0 %	378976147
7	NC_016840	GGA	2	6	419	424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378976147
8	NC_016840	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976147
9	NC_016840	TGA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976147
10	NC_016840	ATCCG	2	10	518	527	20 %	20 %	20 %	40 %	378976147
11	NC_016840	TTC	2	6	529	534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976147
12	NC_016840	GTG	2	6	565	570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378976147
13	NC_016840	T	7	7	581	587	0 %	100 %	0 %	0 %	378976147
14	NC_016840	GT	3	6	591	596	0 %	50 %	50 %	0 %	378976147
15	NC_016840	CGG	2	6	625	630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976147
16	NC_016840	GAAG	2	8	668	675	50 %	0 %	50 %	0 %	378976147
17	NC_016840	TGG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378976148
18	NC_016840	GCT	2	6	905	910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976148
19	NC_016840	CGG	2	6	1081	1086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976148
20	NC_016840	ATG	2	6	1109	1114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976148
21	NC_016840	ATG	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976148
22	NC_016840	CTCA	2	8	1226	1233	25 %	25 %	0 %	50 %	378976148
23	NC_016840	ACG	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976148
24	NC_016840	TGA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976148
25	NC_016840	CAT	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976148
26	NC_016840	ATG	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976148
27	NC_016840	GA	3	6	1582	1587	50 %	0 %	50 %	0 %	378976148
28	NC_016840	CAGA	2	8	1597	1604	50 %	0 %	25 %	25 %	378976148
29	NC_016840	CTGAAC	2	12	1611	1622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378976148
30	NC_016840	AGA	2	6	1677	1682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976149
31	NC_016840	AGTC	2	8	1916	1923	25 %	25 %	25 %	25 %	378976149
32	NC_016840	ACA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976149
33	NC_016840	TGGG	2	8	2030	2037	0 %	25 %	75 %	0 %	378976149
34	NC_016840	TG	3	6	2065	2070	0 %	50 %	50 %	0 %	378976149
35	NC_016840	GCG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976149
36	NC_016840	GAA	2	6	2657	2662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976150
37	NC_016840	GAT	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378976150
38	NC_016840	CTT	2	6	2735	2740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976150
39	NC_016840	CAG	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976150
40	NC_016840	CTGG	2	8	2779	2786	0 %	25 %	50 %	25 %	378976150
41	NC_016840	TG	3	6	2976	2981	0 %	50 %	50 %	0 %	378976150
42	NC_016840	CGT	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976150
43	NC_016840	GCA	2	6	3407	3412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976150
44	NC_016840	A	7	7	3467	3473	100 %	0 %	0 %	0 %	378976150
45	NC_016840	ACG	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976150
46	NC_016840	CGT	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976150
47	NC_016840	AGC	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976150
48	NC_016840	TGGA	2	8	3599	3606	25 %	25 %	50 %	0 %	378976150
49	NC_016840	AAT	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976150
50	NC_016840	GTTA	2	8	3648	3655	25 %	50 %	25 %	0 %	378976150

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.